Член Президиума Российского психологического общества, руководитель секций клинической психологии и психологии гендерной идентичности РПО. Президент Московского психоаналитического общества. Член Международной психоаналитической ассоциации (IPA), член Парижского психоаналитического общества (SPP).
Член редсоветов «Национального психологического журнала», «Сибирского психологического журнала», член редколлегии журналов «Вестник Московского университета. Серия 14. Психология», «Российский психологический журнал».
В 1976 г. окончил факультет психологии МГУ им. М.В. Ломоносова. В 1980 г. защитил кандидатскую диссертацию на тему «Психологический анализ изменений личности при онкологических заболеваниях». В 1991 г. - докторскую диссертацию на тему «Интрацепция в структуре внутренней картины болезни». Стажировки: 1993 – University of Cambridge; 1994-1995 – Universite Paris-VIII; 1999-2002 – Institut de Psychanalyse de Paris.
В 1976-1992 гг. – клинический психолог, научный сотрудник, старший научный сотрудник Онкологического научного центра РАМН. В 1992-2001 – профессор кафедры нейро- и патопсихологии факультета психологии МГУ им. М.В.Ломоносова, ведущий научный сотрудник Научного центра психического здоровья РАМН; с 2000 по настоящее время – зав. кафедрой нейро- и патопсихологии МГУ им. М.В.Ломоносова.
Область научных интересов: клиническая психология, психосоматика, психология телесности, культура и патология, психологические проблемы телесности человека, психологические проблемы семиотики, методологические проблемы клинической психологии и психиатрии, психоанализ.
Описал психологические механизмы патологического развития личности в условиях тяжелого соматического заболевания, сформулированы общие принципы психологической реабилитации онкологических больных. Он обозначил основные принципы разрабатываемых им научных направлений: психологии интрацептивного восприятия и психологии телесности. Психология телесности строится А.Ш. Тхостовым на базе культурно-исторического подхода, в рамках которого тело рассматривается как универсальный знак и орудие. Предложена семиотическая модель болезни и лечебного процесса.